Genetik-Engine (bde4ec70, f89e95ad, 2322c2a8):
- Saphir/Platin/Platin-Hell unterscheiden sich NUR in der C-Zygotie und waren im
Katalog identisch (locusToken reduziert auf das dominante Allel) → Saphir war
unerreichbar. Token darf jetzt ein exaktes, ungeordnetes Allelpaar "x/y"
verlangen: Platin C/C, Saphir C/cchm, Platin-Hell C/ch. TS- und Python-Mirror
identisch, Seeds regeneriert, Migration ReseedColorVarietiesGen6Saphir.
- c[hm] wird als Alias auf c[chm] normalisiert (Tippfehler in zwei Charts) —
vorher war Jays Gencode unparsebar und ergab "Zobel-Hell".
- 6 Tiere wechseln den errechneten Farbschlag (5x Platin→Saphir, Jay→Zobel).
Importer-Logik:
- renameTo-Notiz-Sweep: der alte Name blieb in Wurf-Notizen stehen ("Blacky +
Kruke") — jetzt wortgenau ersetzt, mit vier Guards gegen Kollateralschaden.
- Neuer Resolution-Schlüssel goHomeDate (autoritativ, zieht GivenAway nach) und
spottingType; Gencode-Overrides gewinnen jetzt bei präzisem Match (vorher
wurden Entscheidungen stumm verschluckt, z. B. Eliza und Chris).
- parse_date verwirft implausible Jahre (JackJack hatte 1310-05-13).
- extract.py erkennt Stammbaum-Blöcke auch ohne Stern vor dem Geburtsdatum
(Bijou bekam dadurch den Nachbar-Ast als Mutter).
- Backend-Ingest überträgt SpottingType (nur bei Payload-Wert).
Daten (conflict-decisions.json, re-ingest-stabil): Kuke-Merge + Zuchtname,
Jamie- und Sakura-Dubletten, Phantom-Tier "Unbekannt", Eltern von Kathlin,
Fast Boy/Ziwa und dem Q4-/TS-Wurf, Eliza-Gencode, Merle-Abgabe, JackJack.
Frontend (24522f5f): Abgabedatum steht in der Tier-Akte jetzt direkt unter dem
Abnehmer und hängt nicht mehr am Status.
Tests: +25 Checks test_merge_resolve, +7 test_genotype, +8 genetics.test.ts,
neuer Extract- und Ingest-Test, e2e GOHOME-ROW. Alles grün.
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Die Züchterin hat 24 neue/aktualisierte Stammbaum-xlsx geliefert (Ordner
"neuestammbäume"); sie liegen jetzt im kanonischen Quellverzeichnis
Sttammbäume (12 neue Charts, 7 aktualisierte, 3 identisch, das inhaltsgleiche
"Picus Son (2)" ausgelassen). Prod ist per Upload-Ingest aktualisiert:
2372 -> 2451 Tiere, 916 -> 965 Würfe, 432 -> 507 Fotos, 2198 -> 2275 Tiere
mit Geburtsdatum. Overrides/verified-Zeilen, manuelle Tiere und Tickets
haben den Ingest unverändert überlebt.
Zwei Datenfehler, die die neuen Charts aufgedeckt haben — datengetrieben und
re-ingest-stabil gefixt statt an der globalen Heuristik zu drehen:
- litterChildren kennt jetzt `add` [Name | {name, dob}] als Gegenstück zu
`keep`: hängt ein Jungtier an DIESEN Wurf und entfernt den alten Wurf, wenn
er dadurch kinderlos UND virtuell ist. Nötig, weil "Pukas Kids" Akanes
Eltern komplett UNTER ihren Block setzt (N80 Roni = Vater, N81 Fumi =
Mutter) — _reconstruct_parents griff eine Zeile zu hoch, paarte Irish
Coffee (Bonapartes Mutter) mit Roni und riss Akane aus dem Z21-Wurf in
einen Phantom-Wurf, der in der Wurfchronik auftauchte (Ticket 88389f8e).
- Merle: durch das neue Geburtsdatum (18.06.2023) mergt der addAnimals-Stub
in den Chart-Datensatz und verliert dabei sein isResident -> expliziter
resolutions-Override (Ticket 36a3fcde/a8f11ac0, Züchterin: Zuchttier).
Außerdem: Excel legt neben Fotos teils EMF/WMF-Vektorvorschauen ab, die
Browser nicht darstellen können (kaputte Bildkachel in der Tier-Akte) ->
extract._attach_photos überspringt .emf/.wmf (5 Fotos betroffen).
Regressionstests für alle drei Punkte; alle Python-Suites grün.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
genotype.py: Python-Port von genotypeToFarbschlag (0 Abw. über 3402 Genotypen).
resolve_color_and_genotype: bei vorhandenem Genotyp gewinnt der berechnete Farbschlag
(Goldfuchs≠Gold, Dilute Agouti/Anthrazit, Blaufuchs statt -schimmel bei (schimmel),
spsp statt Schecke). Mamta Mini: Ee + Eltern Geely×Gaida am Wurf. Regressionstests je Fall.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Der Herkunfts-Verlauf nennt jetzt auch, wenn ein Wert aus einer Quelle VERWORFEN
wurde — mit Grund und was stattdessen verwendet wurde (⚠-Markierung), z. B.:
- „⚠ Vater-Kandidat ‚Danielle' (*04.03.2020) verworfen — falsches Geschlecht für
die Vaterrolle; ‚Hagrid Rubeus' verwendet." (Molly)
- „⚠ Geschlecht weiblich aus ‚Wurfchronik.docx' verworfen — abweichend; männlich
aus ‚Alberto Kids.xlsx' verwendet (Mehrheit)." (Solice)
- „⚠ Vater ‚Jasper Jacob' (*2018) verworfen — unplausibel (7 Jahre älter); kein
Ersatz." / DOB-Remap: „⚠ Geburtsdatum 22.08.2018 verworfen — per manueller
Entscheidung korrigiert; 14.07.2019 verwendet." (Kazuya)
Import: generischer _format_discard()-Helfer; Verwerfungen aus Mehrheitsentscheid,
pick_parent_ref-Ablehnungen (explain_pick_rejections), Rollen-Normalisierung,
Eltern-Alter-Sanity-Check und DOB-Remaps werden über _discarded/_prov_args an die
Tiere gehängt; Gerbil-Provenance wird in einem finalen Pass gebaut (nachdem alle
Verwerfungen feststehen). Frontend hebt ⚠-Zeilen ab (+ Legende).
Tests grün (python merge/extract, vitest 129, playwright 8, dotnet 212).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Fotos liegen in den Stammbaum-xlsx je nach Datei links, rechts oder auf der
Namenszelle. Die alte Seiten-Erkennung hing an festen Spalten (col 1 / col 4):
Blätter ohne solche Anker wurden als Rechts-Layout fehlgedeutet, wodurch jedes
Foto eine Generation zum Probanden hin verrutschte. Folge: Kazuya trug das Foto
seines Vaters (Wilbur), Wilbur das seines Großvaters (Elay), Elay hatte keins.
Fix (extract._attach_photos): beide Interpretationen (links/rechts) durchrechnen
und die wählen, die jedes Foto am nächsten an die Namensspalte seines Tiers legt
(minimale horizontale Fehlausrichtung). Diagnose über alle 42 Dateien: keine ist
echt rechts-seitig; ~21 waren fehlklassifiziert. Selbstjustierend statt fester
Spalten-Annahme.
Regressionstest in test_extract.py: Kazuya ohne Foto, Wilbur/Elay mit ihren
eigenen (gated auf vorhandene Quelldatei).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
CR-9 (major): gidByNameDob TryGetValue + ExternalRef-Fallback
Verhindert KeyNotFoundException wenn Name/DOB zwischen zwei Laeufen driftet
(z.B. correctDob-Remap oder UI-Umbenennung). Fallback: ExternalRef-Dict-Lookup;
bei Miss: sauberes Ueberspringen + Note statt 500. +Test CR9_NameDOB_drift.
CR-11 (major): Farbschlag aus Genotyp ableiten (fill-NULL-only)
Deep-Band-Tiere (gen>=2, kein Farbschlag-Feld) landen nicht laenger mit null
ColorVariety. GenotypePotentiallyMatches() vergleicht locus-pair-weise (??=wildcard,
case-insensitive). Nur vollstaendige Genotypen (8 Loci, kein ??) loesen Ableitung aus.
Plan-Loop: fuellt colorVarietyId bei null + vollstaendigem Genotyp.
Post-Sweep: bestehende DB-Tiere mit null ColorVarietyId werden nachgefuellt.
AnimalSummary.FarbschlagDerivedFromGenotype = Zaehler. +Test CR11_ColorVariety_from_geno.
CR-10 (major, Python): malformed Override-Genotyp wird nicht angewendet
apply_conflict_decisions validiert mapped8locus nach gt.parse(). Leeres Ergebnis
= Genotyp unveraendert + decisionWarning statt stillem Blanken. Konflikt wird
trotzdem aufgeloest (Entscheidung gilt, nur Genotyp-Override ausgelassen).
+5 Python-Tests (CR-10-Block in test_extract.py).
DB-1 (high): filtered unique index auf Gerbil.ExternalRef
WHERE ExternalRef IS NOT NULL — verhindert doppelten Import bei Race-Conditions
oder Lauf-Ueberschneidungen. Migration UniqueExternalRef. SQLite-Testhost:
HasFilter() wird via EnsureCreated appliziert (SQLite unterstuetzt Partial-Indexes).
PartialUpdateTests externalRef-Assertion auf NotNull geaendert (name-hash unique).
GATE: 139/139 C# + Python ALL PASS, ef has-pending=No.
1) TOLERANTER KC-MATCHER (extract.py norm_zucht): trailing \b nach '.' greift nicht
zwischen two non-word-chars (z.B. nach '.' vor ' '). Fix: r\bv\.\s?d\. (kein \b
am Ende). Alle Schreibvarianten ('Zucht der Kleinen Chaoten', 'kleinen Chaoten',
'v.d. Kleinen Chaoten', '[ZdkC]') -> canon 'kleinechaote'. +is_clan_zucht() helper.
+11 Python-Tests (Regression + neue Varianten). FIX-1-Entscheidungs-Matching
unberuehrt (canon_pair loest v.d. bereits via split_name_zucht).
2) HERKUNFT-BACKFILL (ImportService.cs, fill-NULL-only): POST-Sweep ueber alle
DB-Tiere mit OriginBreeder==null && IsResident==true. Leitet OriginBreeder aus
dem Elterntier (FatherId/MotherId -> OriginBreeder) ab; Fallback 'Zucht der
Kleinen Chaoten'. NIEMALS ueberschreibt nicht-leeren OriginBreeder. Trocken-Lauf
zaehlt HerkunftBackfilled; Execute schreibt. Fixt Tier 'C' (OriginBreeder null).
3) FARBSCHLAG-WOULD-REBACKFILL (no-op Zaehler): zaehlt bereits-importierte Tiere,
bei denen der aktuelle Extraktor einen anderen Farbschlag liefert als in der DB.
Kein Overwrite (Sicherheitsmechanismus ausstehend auf god/Julian-Freigabe);
Optionen A/B/C an god gemeldet, Empfehlung: Option B (Timestamp-basiert).
4) ResidencySummary um HerkunftBackfilled + FarbschlagWouldRebackfill erweitert.
ImportReport-Notizen fuer beide neuen Zaehler.
GATE: 133/133 C#-Tests, 57 Python-Tests, ef has-pending=No.
FIX-1 ZUCHT: apply_conflict_decisions/apply_dob_remaps matchen jetzt
auf das VOLLE canon_pair-Tupel (nameCanon, zuchtCanon, dob) wenn die
Decision eine Zucht traegt; Fallback name-only wenn keine Zucht.
C3-Regel gewahrt: gleicher Name+DOB, andere Zucht -> kein Hit.
Neuer Regression-Test: Luna ZdkC-Decision trifft nur luna-kc,
nicht luna-bf (andere Zucht).
FIX-2 MERGE: dedup() waehlt das spezifischste Genotyp (fewest '?'
alleles) als sekundaeren Tiebreaker nach locus-count. CC schlaegt C-,
Gg schlaegt G- unabhaengig von der Reihenfolge. 3 neue Merge-Tests
(C- first/CC first/G-vsGg).
FIX-3 BACKFILL allDbNormToGid: ResolveParentForBackfill prueft jetzt
BEIDE Quellen: (a) createdAnimalByName (aktiver Lauf) und
(b) allDbNormToGid (alle DB-Tiere). Decktt den kritischen Fall:
Elterntier in fruehrem Lauf geladen, in diesem Lauf absent vom
Extract. Neuer 3-Lauf-SQLite-Test: Lauf 1 null-Vater, Lauf 2 laedt
Vater, Lauf 3 backfillt via allDbNormToGid.
Gate: 125/125 C#-Tests, Python ALL PASS, has-pending-model-changes=No.
Co-Authored-By: Claude Sonnet 4.6 (1M context) <noreply@anthropic.com>
FIX-1 decision-matching: apply_conflict_decisions/apply_dob_remaps
nutzen jetzt canon_pair(name)[0] als Match-Key (Dedup-Identitaet:
call-name ohne Zucht, v.d.<->von den gefaltet). Workaround-Spelling
v.d. in Victoria Welbys Decision bleibt erhalten; beide Formen
matchen jetzt. Kommentar im decision-Eintrag aktualisiert.
FIX-2 specific-wins: _alleles_compatible aendert '? vs x = False'
-> '? vs x = True' (spezifischer Wert gewinnt). C- vs CC, G- vs Gg,
P? vs PP sind kein Konflikt mehr. Echte Wert-Widersprueche (DD vs Dd,
Ee vs ee, PP vs Pp) bleiben Konflikte. Loest Enya, Ella, Zac
automatisch (Konflikte 8->5 erwartet). 2 bestehende Tests angepasst,
7 neue Tests.
FIX-3 parent-FK backfill: nach dem Wurfchronik-Rueckverknuepfungs-
Block iteriert ImportService.RunAsync ueber bereits importierte
Wuerfe mit null Father/MotherId und setzt fehlende FKs wenn das
Elterntier jetzt ladbar ist. Trockenlauf zaehlt, Execute schreibt.
LitterSummary.ParentFksBackfilled + 2 neue C#-Tests (SQLite).
FIX-4 Skarlett-Artefakt: parse_detail() strippt trailing / +YEAR
aus dem Genotyp-Tail (re.sub). Sterbejahr bleibt als death-Date
erhalten -> Skarlett erscheint als reiner Sterbedatum-Konflikt.
2 neue Python-Tests.
Gate: 124/124 C#-Tests, Python test_extract/test_genotype ALL PASS,
has-pending-model-changes = No.
Co-Authored-By: Claude Sonnet 4.6 (1M context) <noreply@anthropic.com>
god added a `correctDob` (DD.MM.YYYY) decisions field: the matched (name+dob)
record is a DUPLICATE with a wrong birthdate → remap its DOB to correctDob so
dedup MERGES it into the canonical same-named animal. apply_dob_remaps runs
BEFORE dedup (it changes the dedup identity); tolerates a missing file; logged
as "DOB-Remaps: N". First use: Chelsea *15.10.2021 → *02.04.2021 (merges into
the canonical record). test_extract covers the remap + that both records then
share one name+dob identity.
Extractor-only. python + dotnet 121/121 green.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
Breeder merge rule: when two source variants of the SAME animal differ ONLY
by a token PRESENT in one and ABSENT in the other — a whole locus (e.g. spsp
charted in one source, omitted in another) or a modifier on the same base
allele (e^f vs e, the [f] marker) — keep the present token; that is NOT a
conflict. Genuine VALUE contradictions still quarantine: different base
alleles (Ee↔ee), unknown-vs-filled (D-↔DD), different modifiers (c[h]↔c[chm]),
C-↔Cc[h], P-↔Pp.
Replaces the old `len(distinct normalized geno keys) > 1` test with
_genotype_conflict() (per-locus, per-allele compatibility; '?'-vs-filled is a
contradiction, modifier-present-vs-absent and whole-locus-absence are not).
Markers/flags (WP/DP/WFNZ/hörend) are already tags/flags, never genotype, so
they never reach conflict detection; empty Farbschlag/death already don't
conflict (only non-empty values are compared).
Clears Daja (keep spsp), Ichika (keep ee[f]) and the D4 marker cases:
Konflikte 19 -> 15. test_extract covers spsp/[f] present-vs-absent =
no conflict and the four genuine-contradiction shapes. python + dotnet
121/121 green; extractor-only.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
god extended conflict-decisions.json with an optional dateOfDeath
(DD.MM.YYYY). apply_conflict_decisions now sets the animal's death date
(normalized) as authoritative when present — clearing D5 death-date
conflicts the same way genotype/farbschlag decisions are applied. No C#
change (death already flows to Gerbil.DateOfDeath). test_extract covers a
Flint dateOfDeath resolution. python green.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
god maintains tools/import/conflict-decisions.json as Julian/his wife answer
the D-conflicts. extract.py now consumes it (apply_conflict_decisions): for an
animal matching normalize(name)+dob, it clears the conflict, marks
resolvedByDecision, and — when the decision carries a `genotype` (breeder
notation, parsed via genotype.py) and/or `farbschlag` — treats those as
AUTHORITATIVE. Tolerates a missing/empty/garbled file. Genuinely-unresolved
conflicts stay quarantined.
Loader (ImportService): SourceAnimal.ResolvedByDecision flows through; the
report surfaces Animals.ConflictsResolvedByDecision + a German note.
Result on real data: the 2 current decisions (Firefly D-/PP, WildFire PP)
un-quarantine → Konflikte 21 → 19. As god appends entries the count grows;
nothing else needed from me.
Tests: python test_extract (decision clears conflict + genotype authoritative
+ removes from conflicts list + tolerates missing file) and a C# loader test
(a resolved animal loads and is counted). Folded into the EXTRACT-BANDS branch
so the next re-extract applies band-aware Farbschlag + these decisions in one
pass. No schema change (JSON DTO fields). python + dotnet 121/121 green;
has-pending clean.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
Julian-confirmed against the real xlsx (Kentucky, Akio Kids): pedigree
blocks have two shapes. EARLY bands (gen 0-1, cols B/E/H) are 5-cell
Name/DOB/Farbschlag/Genotype/Zucht — real Farbschlag present. DEEP bands
(gen>=2, cols K/N/Q...) are 3-cell Name/DOB/Genotype with NO Farbschlag —
the colour is derived from the genotype.
The old extractor grabbed the NEXT block's name or a stray health note
(e.g. "DD-Tumor", "Chronische Ohrenentzündung...") as the deep-band
Farbschlag — source of the D1 'name-in-Farbschlag' conflicts and a big
chunk of farbschlagUnmatched. Fix: gen_of(col)>=2 => never assign a
Farbschlag in that block (Name/DOB/Genotype only); the cell is left for the
next block's name search. Deep-band animals load with empty Farbschlag and
the UI computes 'Errechnet' from the stored genotype (lossless).
Dedup already prefers a real (non-empty) early-band Farbschlag, so an animal
appearing in both an early band (Chesnut -> 'Kohlfuchsschimmel') and deep
bands keeps the real value; Chesnut and Tennessee stay separate (distinct
genotype + name+DOB key).
Result: 248/306 loadable animals now have empty Farbschlag (genotype-
derived), 0 suspicious name/note values remain, 0 Farbschlag-based conflicts
(D1 dissolved). Regression test test_extract.py builds a two-band xlsx and
asserts the deep band yields no Farbschlag + the stray note doesn't bleed.
Extractor-only (no C# change). python test_genotype + test_extract green;
dotnet 118/118. Batches with Kevin's GEN-3f seed for one re-import.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
Structural fix (god, Julian-reported via 'C'): the loader ignored
SourceAnimal.ParentRefs, so animals whose ancestry exists only as
Stammbaum chart-position refs loaded with LitterId=null ("unbekannt").
ImportService now synthesizes/reuses a derived litter from parentRefs:
resolves father+mother via name+DOB, groups siblings (same parents+dob)
into one litter, sets Father/Mother + offspring LitterId, dates it to the
offspring DOB, and tags Notes "aus Stammbaum-Diagramm abgeleitet
(Konfidenz: …)" so it's transparent/reversible. Existing animals that
become linkable are re-linked on re-run (sweep-idempotent). Dry-run counts
included. Projected: ~124 loadable animals gain a parent link.
Box-colour = sex (Julian): blue box = male, white box = female. All 11
pedigrees encode this as a solid theme-8 (accent5/blue) fill vs no fill.
xlsx_util.cell_fill_sex reads it; extract.py sets animal.gender from the
box; ImportService.InferGender prefers it over sire/dam name inference.
Result: 306/306 loadable animals now sexed (154♂/152♀).
Extractor noise fix (god): reject Farbschlag values that are actually a
parent NAME bled across cells (contain v.d./von/of/gen.) — cleared phantom
conflicts (e.g. Chayton). Combined with GEN-3 Uw→G: Konflikte 32→21.
Also skip Excel "~$" lock files in the glob.
GEN-3a contract (Kevin): ComposeGenotype appends "Slsl" for WP/Sls
carriers (wild-type sl/sl omitted) so 8-locus strings stay unchanged.
Importer-only. The live re-import into Julian's DB stays a separate
supervised gated step. 95 C# tests + python genotype tests green;
has-pending-model-changes clean (no schema change on this branch).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
genotype.py:
- Uw/uw aliased to G/g (same locus) so the D2 conflict group + pure-Uw
cases stop being conflicts (Gg == Uwuw).
- Sls/WP recognized as a SECOND spotting locus (S(l)s(l)=WP het); carried
into mapped8locus alongside Sp (Sp+Sls = Superschecke).
- dea/Dea/taub/hörend -> hearing/deaf phenotype FLAG (not a locus).
- WFNZ/RV/GV/DP -> provenance/breeding tags (not genotype, not conflicts).
- test_genotype.py: zero-dep unit tests for all four.
extract.py: surface deaf+tags on animals; dedup conflict detection now
compares the NORMALIZED genotype key (mapped8locus) instead of the raw
string, so Uw=G no longer triggers a conflict. Result: Konflikte 32 -> 27,
Zucht-Splits stays 0. Dedup identity = name + DOB + Zucht.
Backend: Gerbil.IsDeaf (bool?) + additive migration AddGerbilDeafFlag
(has-pending-model-changes clean) + GerbilDto/GerbilInput round-trip.
ImportService sets IsDeaf from animal.deaf and preserves Sls + tags + deaf
in RawImportData (kept out of the 8-locus compact Genotype contract until
GEN-3a adopts them).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
Adds a machine-readable conflict:bool to each merged animal (true when files
disagree on genotype/farbschlag/death) so the import loader can quarantine the
32 conflicts without parsing the German review report.
- survivedToGoHome: unlabeled Tabelle1 col E detected positionally; value-
adaptive row parsing recovers it from schema-shifted Tabelle2 rows too
(118 recovered, 79 confirmed by the E=F-TG-s identity)
- breakdown G -> males/females/stillborn/diedLater ('s' = died before Abgabe)
- validation: E = F - TG - s; 113 mismatches as German review-report warnings
- (name, Zucht) canonicalisation: [brackets] == of/von suffix ([ZdkC] ==
von den Kleinen Chaoten); Zucht = dedup discriminator (0 splits in data)
- animal->litter matching via DOB+(Vater,Mutter): 95 high-confidence,
40 date-only, 9 ambiguous; litterRef in animals.json
- regenerated report: 889 raw -> 574 unique (279 dated), 32 conflicts
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
