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0540498e85 Merge branch 'worktree-agent-a7281df1f2cc3f1f1'
# Conflicts:
#	gerbil-manager-web/src/genetics/catalog.ts
#	gerbil-manager-web/src/genetics/genotype.ts
#	gerbil-manager-web/src/genetics/punnett.ts
2026-06-23 09:29:42 +02:00
8c1ee75b81 fix(genetics): Engine-Fixes Ticket-Triage (Goldfuchsschimmel, Dilute CP-Blaufuchs, Eltern-Inferenz, Punnett, uw[d])
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
2026-06-23 09:05:35 +02:00
b437d09312 fix(genetics): Genotyp-/Farbschlag-Engine-Bugs aus Ticket-Triage
- uw/Uwuw[d] (dichtes Underwhite) wird vor dem uw→G-Locus-Alias korrekt geparst
  (Vance: nicht mehr „Unbekannter Farbschlag", zeigt G-Locus statt international uw). [#34,#32]
- ee[-] = sichtbarer Fuchs (rezessiv homozygot) → korrekt als Fuchs; bare „e-"
  (rezessiv + unbekannt) ist genetisch unmöglich → genotypeInvalid statt still falsch. [#42]
- aa-Colourpoint-Zweig berücksichtigt jetzt D (Dilute) und E (Fuchs), statt fix
  Zobel/Marder/Siam zu erzwingen. [#3]
- Wurf-Farbprognose: unbekanntes Allel (?) wird nicht mehr über die volle Dominanz
  expandiert → keine unmöglichen Dilute-/Schimmel-/„Unbekannt"-Nachkommen. [#37,#39,#40,#41,#38]

Tests: test_genotype.py erweitert; genetics.test.ts +5 Blöcke (135 vitest grün, tsc/eslint sauber).

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
2026-06-22 21:04:05 +02:00
04d189bd2f FEAT: genotype parsing resilience and displayGenotypeSafe format helper 2026-06-08 21:19:11 +02:00
d5c155953b GEN-4d: rere (Re-Wildtyp) aus Anzeige ausblenden (Julian)
- genotype.ts: toDisplayString filtert Re aus wenn re/re (Wildtyp) —
  analog zur bestehenden Sls-Regel; Rere/ReRe bleiben sichtbar.
  Wildtyp-Anzeige jetzt 7 Loci: AA CC DD EE GG PP spsp (ohne rere).
- StammbaumPage.tsx: Druck-Ahnentafel nutzt toDisplayString(fromDisplayString(g.genotype))
  statt rohem g.genotype-String (Audit: einzige Display-Stelle ausserhalb toDisplayString).
  (GerbilDetailPage/BreedingResultView gehen bereits via toDisplayString.)
- genetics.test.ts: Alle Display-String-Assertions auf 7-Loci-Format aktualisiert;
  Rere-Nachweis zum Sls/Re-Test ergaenzt; Katalog-Regex auf {6,8}.
- colorVarietySeed.generated.json regeneriert (kein rere in canonicalGenotype).
- backend.json unveraendert (Pam: DB-Speicherung bleibt volles 8-Loki-Format).
2026-06-07 01:28:06 +02:00
b72e0a9d9a GEN-4c: PEW=REW konsolidiert (Julian) + REW-2-Verifikation
- catalog.ts: 'Pink Eyed White (PEW)' -> 'REW' (frozen rename; chch+pp
  engine-computes 'REW' per Julian; entry now round-trips correctly)
- genetics.test.ts: REW_SHADOWED-Ausnahme entfernt (kein Bedarf mehr);
  CATALOG[0]-Assertion auf 'REW'; aa cchmcchm+pp-Test als REW-2-Nachweis
  (Julian: A-Locus egal fuer REW-Bedingung)
- chipColors.ts: 'REW'-Chip ergaenzt (gleiche Farbe wie PEW; additive;
  PEW-Eintrag bleibt fuer Rueckwaertskompatibilitaet waehrend DB-Migration)
- Seed-Artefakte regeneriert (70 Reihen, REW statt PEW an Position 0)
- FLAGGED to god: 'Altweiss (REW)' hat volles C (C:'C') -> faellt NICHT
  unter REW-Bedingung; warte auf Julian-Entscheid vor Aenderung
2026-06-07 01:08:23 +02:00
ff42341c47 GEN-4 Addendum: 7 Farbarten-Kategorien blockiert + locusToken ef/e-Fix
catalog.ts:
- locusToken E: ef/e -> 'ef' (phenotypisch ausgedrücktes Allel; enables
  catalog-Match fuer het Schimmel-Tiere wie Kohlfuchsschimmel/Orangeschimmel).
  Vorher: 'eef' matchte keinen Katalogeintrag -> Family-Fallback 'Fuchsschimmel'.
- baseColourFor: Family-Fallback entfernt (null statt family-Name) — Familie
  ist nur noch Katalog-Suchfilter, nie direkter Ausgabewert.
- CATEGORY_NAMES Guard in farbschlagFor: Fuchs/Fuchsschimmel/Schimmel/Standard/
  Colourpoint/Dilute/Colourpoint Dilute -> Unbekannter Farbschlag wenn Engine
  diese Namen zurueckgeben wuerde.
- Orangeschimmel: A:'A' hinzugefuegt (Agouti-Einschraenkung), damit aa-ef-Tiere
  durch zu Kohlfuchsschimmel fallen.
- FK-Check: Keine der 7 Kategorie-Namen sind in BASE_COLORS -> 0 FK-Risiko.

genetics.test.ts:
- 'eef with unknown other loci': erwartet jetzt 'Kohlfuchsschimmel' (korrekt!)
- GEN-4 Farbarten-Fixture: Kategorie-Guard-Test + FK-Check-Assert.
Gate: build ✓  eslint ✓  vitest 96/96 ✓  e2e 148/148 ✓
2026-06-06 21:42:15 +02:00
5c327cd8d8 GEN-4 REW erweitert: alle 3 C-Kombi + pp = REW (Julian bestätigt)
- cReduced(c) = cchm || ch; REW wenn cReduced(c0) && cReduced(c1) && pp
  (cchm/cchm, cchm/ch, ch/ch alle REW; mind. ein volles C = NICHT REW)
- Counterproof-Test: C/cchm + pp und C/ch + pp = nicht REW
- Frozen-Round-Trip-Test: PEW (ch/ch+pp) explizit ausgenommen (intentional
  shadow durch REW-Check per Julian-Regel; PEW bleibt Dropdown-Name)
Gate: build ✓  eslint ✓  vitest 95/95 ✓  e2e 148/148 ✓
2026-06-06 21:32:20 +02:00
b12b5d720d GEN-4: Dilute-Präfix, REW-Erkennung, CP-Fuchs-Fix, BreedingResultView Gencode+Layout
Katalog (catalog.ts):
- 8 'X dd'/'dd X' Einträge → 'Dilute X' (Agouti/Silberagouti/Kohlfuchs/Anthrazit/
  Topas/Blaufuchs dd + dd Gold/Platin → Dilute Gold/Platin etc.)
- 4 neue Dilute-Fuchs-Basiseinträge (Dilute Algierfuchs/Goldfuchs/Rotfuchs/Polarfuchs)
  → verhindert naked 'Fuchs' Fallback für agouti+dilute+fox Genotypen. 66→70 Einträge.
- colourpointName: 'Dilute X' Base → 'Dilute CP-X' statt 'CP-Dilute X' (Präfix-Reihenfolge)
  → AA cchmcchm dd ee GG PP = 'Dilute CP-Algierfuchs' statt 'CP-Fuchs'.

Engine (farbschlagFor):
- REW-Check: c0==cchm && c1==cchm && p0==p && p1==p → 'REW' (Rotaugenweiß).
  Unabhängig von A/D/E/G. Flagged to god zur Bestätigung.

BreedingResultView:
- Gencode (bracket notation) pro Farbschlag-Karte (erster/wahrscheinlichster Genotyp).
- Layout-Fix: flexbox body (name+gencode gestapelt), min-width:0 gegen Overflow,
  word-break, grid min 15rem, prob flex-shrink:0 rechtsbündig.

Tests: GEN-4 describe (Dilute/REW/no-bare-Fuchs Fixtures); CATALOG_SIZE 66→70;
  CP-Fuchs/CP-Fuchs-Hell → Dilute CP-Algierfuchs(-Hell) in bestehenden Tests.
Gate: build ✓  eslint ✓  vitest 95/95 ✓  e2e 148/148 ✓
2026-06-06 21:27:32 +02:00
52303b90b2 CR-1a: ee[-] Parser-Fix (Silvain) — lookbehind trennt e[-] vom führenden Allel
normalizeToken: lookbehind-Regex /(?<=[A-Za-z])e\[-\]/→'?' greift wenn e[-]
von einem Buchstaben (erstes Allel) gefolgt wird (ee[-] → e?); standalone e[-]
fällt durch auf die generische \[-\]→? Regel (→ e?). Beide Pfade liefern
splitToken 2 Allele [e,?]. Vorher: ee[-]→ee?→ 3 Allele → Fehler.
Fixture: Silvain 'aa c[chm]c[chm] Dd ee[-] Gg Pp Spsp' → E=[e,?] ✓.
Gate: build ✓  eslint ✓  vitest 92/92 ✓  e2e 126/126 ✓
2026-06-06 18:24:06 +02:00
4b6a07544d GEN-3h: Breeder bracket-notation display + E-locus e-vor-e[f] Sortierung
- genotype.ts: toDisplayString zeigt ef→e[f], cchm→c[chm], ch→c[h] (Display-only;
  Storage-Contract unverändert). E-Locus Display-Rank E>e>ef: {ef,e} Paar
  rendert als ee[f] statt e[f]e (Züchterin-Konvention, Julian-Feedback).
- genotype.ts: normalizeToken akzeptiert Klammer-Eingabe (e[f], c[chm], c[h],
  [-]) → interne Symbole; vollständiger Round-Trip Display→Parse.
- genetics.test.ts: Katalog-Regex auf [A-Za-z[\]?-]+ erweitert; GEN-3h
  Notation-Fixtures (C/Zuleika/Milka-Orakel, Klammer-Round-Trip, E-Sortierung).
- colorVarietySeed.generated.json: neu generiert (66 Zeilen mit Klammer-Notation).
Gate: build ✓  eslint ✓  vitest 91/91 ✓  e2e 120/120 ✓
2026-06-06 18:24:06 +02:00
efce79b3fa GEN-3g: CP colourpoint het-naming rule — '-Hell' == cchm/ch (breeder C9 answer)
- colourpointName(): A- cchm/ch now yields 'CP-<base>-Hell' (was 'CP-<base>');
  A- cchm/cchm unchanged. Non-agouti branch (Marder/Siam/Zobel/Zobel-Hell)
  unchanged — already used the het token.
- Added 5 new catalog entries: CP-Agouti-Hell, CP-Silberagouti-Hell,
  CP-Algierfuchs-Hell, CP-Polarfuchs-Hell, CP-Orangeschimmel-Hell.
  CP-Fuchs-Hell was already present. Catalog 61 -> 66.
- Regenerated colorVarietySeed.generated.json (66 rows for Pam DATA-2 re-seed).
- Tests: 82 -> 82 (reworded het case) + 1 new GEN-3g describe block. All pass.

Co-Authored-By: Claude Sonnet 4.6 (1M context) <noreply@anthropic.com>
2026-06-06 15:14:23 +02:00
972570b142 GEN-3f: reconcile cchm colourpoint catalog to the breeder's CP- naming
Computed Farbschlag now == the breeder's dropdown/seed names for colourpoints,
so the mismatch hint stops and the live re-import name-matches her data
(god: she uses the CP- prefix form + Marder/Siam/Zobel/Zobel-Hell; ZERO of the
old portal suffix names). FULL collapse (god-approved, data-safe).

Catalog (BASE_COLORS) 73 -> 61: the 24 portal cchm rows collapse to 12 breeder
varieties — Marder, Siam, Zobel, Zobel-Hell (aa marten/sable group; E & D
irrelevant per the merged GEN-3e rule) and CP-Agouti, CP-Silberagouti,
CP-Algierfuchs, CP-Polarfuchs, CP-Fuchs, CP-Fuchs-Hell, CP-Blaufuchs,
CP-Orangeschimmel (A- 'CP-<base>'; -Hell shade variants collapsed).

- representativeGenotype() now splits a heterozygous 'x/y' token, so the het
  colourpoints Siam & Zobel-Hell (C: 'cchm/ch') carry the correct het canonical
  genotype and the engine computes their own names (verified).
- Engine covers all fox(ee)/dilute(dd) A- cchm bases via the E-family fallback
  (no Unbekannt). KNOWN BEST-EFFORT GAP: CP-Fuchs-Hell and CP-Blaufuchs both
  compute 'CP-Fuchs' (the het-lighter / blue-dilute distinction isn't encoded);
  their distinct rows remain for hand-pick + import name-match. Closing this
  fully needs the breeder's exact fox-CP genotype rule.

Regenerated colorVarietySeed.generated.json (61 rows) for Pam's re-seed
migration. Gate green: build, eslint, vitest 78, e2e 80. de.ts untouched.

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
2026-06-06 11:47:40 +02:00
5fd8cf4395 GEN-3e: C-locus colourpoint naming (CP-<base> for A-+cchm; Marder/Siam/Zobel/Zobel-Hell for aa+cchm); chch kept as Hermelin/Himalaya via base-match 2026-06-06 11:04:57 +02:00
8125c453d0 GEN-3d: dominance tiebreak — unknown locus resolves to wild-type reading (unknown-C => full-colour, not c[h] white; markers default unmarked) 2026-06-06 10:58:15 +02:00
c35a6eca04 GEN-3c: fix 'Unbekannter Farbschlag' — unknown=wildcard in matches() + E-pair-aware family fallback (eef=Fuchsschimmel) 2026-06-06 10:45:16 +02:00
e2fd32ea12 GEN-3a: test that Uw input renders as canonical G (never echoed back) 2026-06-06 10:27:08 +02:00
7aac59f3e5 GEN-3a: de.ts warning texts (SLS_LETHAL/SUPERSCHECKE_DEAF) + genetics tests (Uw alias, Sls het/lethal, Superschecke, flag tolerance, Schimmel fix) 2026-06-06 10:25:48 +02:00
a9778ad1d2 GEN-2: expand Farbschlag catalog 18->73 (baseportal.de) + images + collision-aware tests
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
2026-06-06 00:55:35 +02:00
3629e89e87 GEN-1: expose CATALOG seed view (Name/CanonicalGenotype/SortOrder) for DATA-2 + round-trip test
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
2026-06-05 23:47:11 +02:00
0408a482cf GEN-1: export genotypeToFarbschlag for DATA-1 denormalization contract
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
2026-06-05 23:45:07 +02:00
3561b435d5 GEN-1: add vitest suite (worked example, SpSp renorm, wildcards) + erasable-enum fix
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
2026-06-05 23:43:21 +02:00