REVIEW-FIXES-BACKEND: CR-9 + CR-11 + CR-10 + DB-1
CR-9 (major): gidByNameDob TryGetValue + ExternalRef-Fallback Verhindert KeyNotFoundException wenn Name/DOB zwischen zwei Laeufen driftet (z.B. correctDob-Remap oder UI-Umbenennung). Fallback: ExternalRef-Dict-Lookup; bei Miss: sauberes Ueberspringen + Note statt 500. +Test CR9_NameDOB_drift. CR-11 (major): Farbschlag aus Genotyp ableiten (fill-NULL-only) Deep-Band-Tiere (gen>=2, kein Farbschlag-Feld) landen nicht laenger mit null ColorVariety. GenotypePotentiallyMatches() vergleicht locus-pair-weise (??=wildcard, case-insensitive). Nur vollstaendige Genotypen (8 Loci, kein ??) loesen Ableitung aus. Plan-Loop: fuellt colorVarietyId bei null + vollstaendigem Genotyp. Post-Sweep: bestehende DB-Tiere mit null ColorVarietyId werden nachgefuellt. AnimalSummary.FarbschlagDerivedFromGenotype = Zaehler. +Test CR11_ColorVariety_from_geno. CR-10 (major, Python): malformed Override-Genotyp wird nicht angewendet apply_conflict_decisions validiert mapped8locus nach gt.parse(). Leeres Ergebnis = Genotyp unveraendert + decisionWarning statt stillem Blanken. Konflikt wird trotzdem aufgeloest (Entscheidung gilt, nur Genotyp-Override ausgelassen). +5 Python-Tests (CR-10-Block in test_extract.py). DB-1 (high): filtered unique index auf Gerbil.ExternalRef WHERE ExternalRef IS NOT NULL — verhindert doppelten Import bei Race-Conditions oder Lauf-Ueberschneidungen. Migration UniqueExternalRef. SQLite-Testhost: HasFilter() wird via EnsureCreated appliziert (SQLite unterstuetzt Partial-Indexes). PartialUpdateTests externalRef-Assertion auf NotNull geaendert (name-hash unique). GATE: 139/139 C# + Python ALL PASS, ef has-pending=No.
This commit is contained in:
@@ -973,7 +973,19 @@ def apply_conflict_decisions(merged, conflicts, path):
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continue
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a["resolvedByDecision"] = True
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if d.get("genotype"):
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a["genotype"] = gt.parse(d["genotype"])
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# CR-10: validate the parsed genotype — a typo'd decision string yields empty
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# mapped8locus and would silently blank the animal's genotype while marking it
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# 'resolved'. Only apply if the parse produces non-empty loci.
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parsed = gt.parse(d["genotype"])
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if parsed.get("mapped8locus"):
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a["genotype"] = parsed
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else:
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# Keep the existing genotype; flag as a warning in the report.
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a.setdefault("decisionWarnings", []).append(
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f"Ungültiger Override-Genotyp '{d['genotype']}' — "
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"konnte nicht geparst werden (mapped8locus leer). "
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"Bestehender Genotyp behalten; Konflikt wurde trotzdem aufgelöst."
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)
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if d.get("farbschlag"):
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a["farbschlag"] = d["farbschlag"]
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a["farbschlagVariants"] = [d["farbschlag"]]
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