REVIEW-FIXES-BACKEND: CR-9 + CR-11 + CR-10 + DB-1

CR-9 (major): gidByNameDob TryGetValue + ExternalRef-Fallback
  Verhindert KeyNotFoundException wenn Name/DOB zwischen zwei Laeufen driftet
  (z.B. correctDob-Remap oder UI-Umbenennung). Fallback: ExternalRef-Dict-Lookup;
  bei Miss: sauberes Ueberspringen + Note statt 500. +Test CR9_NameDOB_drift.

CR-11 (major): Farbschlag aus Genotyp ableiten (fill-NULL-only)
  Deep-Band-Tiere (gen>=2, kein Farbschlag-Feld) landen nicht laenger mit null
  ColorVariety. GenotypePotentiallyMatches() vergleicht locus-pair-weise (??=wildcard,
  case-insensitive). Nur vollstaendige Genotypen (8 Loci, kein ??) loesen Ableitung aus.
  Plan-Loop: fuellt colorVarietyId bei null + vollstaendigem Genotyp.
  Post-Sweep: bestehende DB-Tiere mit null ColorVarietyId werden nachgefuellt.
  AnimalSummary.FarbschlagDerivedFromGenotype = Zaehler. +Test CR11_ColorVariety_from_geno.

CR-10 (major, Python): malformed Override-Genotyp wird nicht angewendet
  apply_conflict_decisions validiert mapped8locus nach gt.parse(). Leeres Ergebnis
  = Genotyp unveraendert + decisionWarning statt stillem Blanken. Konflikt wird
  trotzdem aufgeloest (Entscheidung gilt, nur Genotyp-Override ausgelassen).
  +5 Python-Tests (CR-10-Block in test_extract.py).

DB-1 (high): filtered unique index auf Gerbil.ExternalRef
  WHERE ExternalRef IS NOT NULL — verhindert doppelten Import bei Race-Conditions
  oder Lauf-Ueberschneidungen. Migration UniqueExternalRef. SQLite-Testhost:
  HasFilter() wird via EnsureCreated appliziert (SQLite unterstuetzt Partial-Indexes).
  PartialUpdateTests externalRef-Assertion auf NotNull geaendert (name-hash unique).

GATE: 139/139 C# + Python ALL PASS, ef has-pending=No.
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2026-06-06 17:54:06 +02:00
parent f6a4025d71
commit 615abfa510
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@@ -973,7 +973,19 @@ def apply_conflict_decisions(merged, conflicts, path):
continue
a["resolvedByDecision"] = True
if d.get("genotype"):
a["genotype"] = gt.parse(d["genotype"])
# CR-10: validate the parsed genotype — a typo'd decision string yields empty
# mapped8locus and would silently blank the animal's genotype while marking it
# 'resolved'. Only apply if the parse produces non-empty loci.
parsed = gt.parse(d["genotype"])
if parsed.get("mapped8locus"):
a["genotype"] = parsed
else:
# Keep the existing genotype; flag as a warning in the report.
a.setdefault("decisionWarnings", []).append(
f"Ungültiger Override-Genotyp '{d['genotype']}'"
"konnte nicht geparst werden (mapped8locus leer). "
"Bestehender Genotyp behalten; Konflikt wurde trotzdem aufgelöst."
)
if d.get("farbschlag"):
a["farbschlag"] = d["farbschlag"]
a["farbschlagVariants"] = [d["farbschlag"]]